Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Fam240aJ3QNP9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Fam240aJ3QNP9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Fam240aJ3QNP9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms