Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Zfp870J3QMA4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Zfp870J3QMA4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Zfp870J3QMA4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms