Protein–RNA interactions for Protein: G5E8S3

E230025N22Rik, Riken cDNA E230025N22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E230025N22RikG5E8S3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
E230025N22RikG5E8S3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
E230025N22RikG5E8S3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
E230025N22RikG5E8S3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms