Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Vmn1r34G3XA52 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r34G3XA52 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Vmn1r34G3XA52 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms