Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Vmn1r58G3X9U3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Vmn1r58G3X9U3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Vmn1r58G3X9U3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms