Protein–RNA interactions for Protein: G3X952

Zkscan2, MCG20985, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan2G3X952 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Zkscan2G3X952 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Zkscan2G3X952 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Zkscan2G3X952 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Zkscan2G3X952 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms