Protein–RNA interactions for Protein: G3X912

Sprtn, SprT-like domain-containing protein Spartan, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SprtnG3X912 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SprtnG3X912 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SprtnG3X912 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SprtnG3X912 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SprtnG3X912 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SprtnG3X912 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SprtnG3X912 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms