Protein–RNA interactions for Protein: F8VPJ6

Rfx7, Regulatory factor X, 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx7F8VPJ6 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Rfx7F8VPJ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rfx7F8VPJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Rfx7F8VPJ6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Rfx7F8VPJ6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rfx7F8VPJ6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms