Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm28038F7BCN9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm28038F7BCN9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Gm28038F7BCN9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28038F7BCN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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Gm28038F7BCN9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm28038F7BCN9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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