Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9S8

Gm2564, C-C motif chemokine, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2564F6Z9S8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm2564F6Z9S8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm2564F6Z9S8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm2564F6Z9S8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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