Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
3110082J24RikF6Z6Z2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
3110082J24RikF6Z6Z2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
3110082J24RikF6Z6Z2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms