Protein–RNA interactions for Protein: F6QL70

Gm17669, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17669F6QL70 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm17669F6QL70 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm17669F6QL70 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Gm17669F6QL70 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gm17669F6QL70 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms