Protein–RNA interactions for Protein: E9Q963

Gm1661, Predicted gene 1661, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1661E9Q963 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gm1661E9Q963 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gm1661E9Q963 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Gm1661E9Q963 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gm1661E9Q963 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms