Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Col22a1E9Q7P1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Col22a1E9Q7P1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Col22a1E9Q7P1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Col22a1E9Q7P1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Col22a1E9Q7P1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms