Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7D5

Arhgef5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef5E9Q7D5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Arhgef5E9Q7D5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Arhgef5E9Q7D5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Arhgef5E9Q7D5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.22
Arhgef5E9Q7D5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Arhgef5E9Q7D5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms