Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FancfE9Q5Z5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FancfE9Q5Z5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FancfE9Q5Z5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FancfE9Q5Z5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms