Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5C9

Nolc1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nolc1E9Q5C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nolc1E9Q5C9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Nolc1E9Q5C9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Nolc1E9Q5C9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nolc1E9Q5C9 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nolc1E9Q5C9 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.4 ms