Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1X6

6430550D23Rik, RIKEN cDNA 6430550D23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430550D23RikE9Q1X6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
6430550D23RikE9Q1X6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
6430550D23RikE9Q1X6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
6430550D23RikE9Q1X6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms