Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Ccdc171E9Q1U1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc171E9Q1U1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
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Ccdc171E9Q1U1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc171E9Q1U1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc171E9Q1U1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
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