Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm3250E9Q1M3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm3250E9Q1M3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm3250E9Q1M3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms