Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

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Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Myo5cE9Q1F5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Myo5cE9Q1F5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.71
Myo5cE9Q1F5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC31.92■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Myo5cE9Q1F5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC31.88■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
Myo5cE9Q1F5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
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