Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B3

Uncharacterized membrane protein C3orf80 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9Q0B3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
E9Q0B3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
E9Q0B3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
E9Q0B3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9Q0B3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9Q0B3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9Q0B3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E9Q0B3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9Q0B3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E9Q0B3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9Q0B3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E9Q0B3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms