Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Parp4E9PYK3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Parp4E9PYK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Parp4E9PYK3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms