Protein–RNA interactions for Protein: E9PWQ3

Col6a3, Collagen, type VI, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 3,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a3E9PWQ3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
Col6a3E9PWQ3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Col6a3E9PWQ3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Col6a3E9PWQ3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a3E9PWQ3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a3E9PWQ3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a3E9PWQ3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Col6a3E9PWQ3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Col6a3E9PWQ3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms