Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc144bE9PVZ3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc144bE9PVZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc144bE9PVZ3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc144bE9PVZ3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms