Protein–RNA interactions for Protein: E9PVJ0

Gm2956, Predicted gene 2956, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2956E9PVJ0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Gm2956E9PVJ0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm2956E9PVJ0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm2956E9PVJ0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm2956E9PVJ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms