Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Clca3bE9PUL3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clca3bE9PUL3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Clca3bE9PUL3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Clca3bE9PUL3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 160.7 ms