Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ26

Kctd18, Potassium channel tetramerisation domain containing 18, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kctd18E0CZ26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Kctd18E0CZ26 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Kctd18E0CZ26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Kctd18E0CZ26 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Kctd18E0CZ26 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms