Protein–RNA interactions for Protein: E0CXS8

Gm8113, Predicted gene 8113, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8113E0CXS8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm8113E0CXS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Gm8113E0CXS8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gm8113E0CXS8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8113E0CXS8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8113E0CXS8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gm8113E0CXS8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms