Protein–RNA interactions for Protein: E0CXC6

4930558K02Rik, RIKEN cDNA 4930558K02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930558K02RikE0CXC6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4930558K02RikE0CXC6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4930558K02RikE0CXC6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4930558K02RikE0CXC6 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms