Protein–RNA interactions for Protein: E0CX23

Umad1, MCG2776, isoform CRA_c, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Umad1E0CX23 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Umad1E0CX23 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Umad1E0CX23 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Umad1E0CX23 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Umad1E0CX23 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms