Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7H8

Cilp2, Cartilage intermediate layer protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cilp2D3Z7H8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cilp2D3Z7H8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cilp2D3Z7H8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cilp2D3Z7H8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms