Protein–RNA interactions for Protein: D3Z0P8

Tmem200b, Transmembrane protein 200B, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200bD3Z0P8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem200bD3Z0P8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmem200bD3Z0P8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmem200bD3Z0P8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms