Protein–RNA interactions for Protein: D3YWX3

9230113P08Rik, RIKEN cDNA 9230113P08 gene, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9230113P08RikD3YWX3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
9230113P08RikD3YWX3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
9230113P08RikD3YWX3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
9230113P08RikD3YWX3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
9230113P08RikD3YWX3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms