Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rexo5D3YW29 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rexo5D3YW29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rexo5D3YW29 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rexo5D3YW29 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms