Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tmf1B9EKI3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Tmf1B9EKI3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Tmf1B9EKI3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tmf1B9EKI3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tmf1B9EKI3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms