Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Cttnbp2B9EJA2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC38.47■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Cttnbp2B9EJA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC38.43■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC38.39■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Cttnbp2B9EJA2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC38.38■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC38.38■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.36■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
Cttnbp2B9EJA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.29■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
Cttnbp2B9EJA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Cttnbp2B9EJA2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms