Protein–RNA interactions for Protein: B8JK39

Itga9, Integrin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga9B8JK39 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Itga9B8JK39 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Itga9B8JK39 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Itga9B8JK39 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms