Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Grik3B1AS29 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik3B1AS29 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Grik3B1AS29 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik3B1AS29 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms