Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slfn8B1ARD8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slfn8B1ARD8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slfn8B1ARD8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slfn8B1ARD8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.3 ms