Protein–RNA interactions for Protein: A6H5Y3

Mtr, Methionine synthase, mousemouse

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrA6H5Y3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MtrA6H5Y3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrA6H5Y3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MtrA6H5Y3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MtrA6H5Y3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms