Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc43a3A2AVZ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Slc43a3A2AVZ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Slc43a3A2AVZ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Slc43a3A2AVZ9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 644.6 ms