Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Rtf1A2AQ19 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Rtf1A2AQ19 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Rtf1A2AQ19 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Rtf1A2AQ19 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.9 ms