Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
Frmpd1A2AKB4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
Frmpd1A2AKB4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC38.69■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.78
Frmpd1A2AKB4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.61■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC38.58■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
Frmpd1A2AKB4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC38.57■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
Frmpd1A2AKB4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.5■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC38.5■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
Frmpd1A2AKB4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC38.44■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
Frmpd1A2AKB4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.5 ms