Protein–RNA interactions for Protein: A2AIV2

Virma, Protein virilizer homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VirmaA2AIV2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VirmaA2AIV2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
VirmaA2AIV2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
VirmaA2AIV2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VirmaA2AIV2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms