Protein–RNA interactions for Protein: A2AFH2

Ube2dnl2, Similar to ubiquitin-conjugating enzyme E2D 2, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2dnl2A2AFH2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Ube2dnl2A2AFH2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ube2dnl2A2AFH2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ube2dnl2A2AFH2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.1 ms