Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Smurf2A2A5Z6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Smurf2A2A5Z6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Smurf2A2A5Z6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Smurf2A2A5Z6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.9 ms