Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Fam71e1A1L3C1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Fam71e1A1L3C1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Fam71e1A1L3C1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Fam71e1A1L3C1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Fam71e1A1L3C1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms