Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LHF2

Vsig10l2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vsig10l2A0A140LHF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vsig10l2A0A140LHF2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vsig10l2A0A140LHF2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vsig10l2A0A140LHF2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms