Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4921501E09RikA0A0R4J054 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
4921501E09RikA0A0R4J054 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms